①东晋元帝侨立兖州于京口(今江苏镇江市)。明帝移治广陵县(今扬州市西北蜀冈上)。其后或治京口，或治盱眙县(今县东北)，或治山阳县(今淮安县)，或治下邳县(今睢宁县西北古邳东)，或治淮阴(今淮阴市西南)，无定处。东晋末始定治广陵县。南朝宋永初元年(420)改为南兖州。元嘉八年(431)割江、淮间为境，辖境大致相当今江苏江淮间地区及安徽凤阳县、滁州市以东地。其后缩小。北齐改为东广州。陈太建中复为南兖州。北周复为东广州，寻又改为吴州。②北魏太和十八年(494)置。治涡阳城(今蒙城县)。辖境相当今安徽蒙城、凤台二县及怀远县西北郊地区。景明中废。③北魏正始四年(507)置。治小黄县(今安徽亳州市)。辖境相当今河南鹿邑、睢县以东，安徽涡阳西北的涡河及西淝河流域。南朝梁中大通四年(532)改为谯州。东魏复原名，北周末改为毫州。